El departamento del Magdalena hace parte de la regiones naturales de la Sierra Nevada de Santa Marta y Valle del Bajo Magdalena.Posee una extensión de 23.188 Km2 , que representa el 2.03% al compararla con el territorio nacional y el 11.5% en relación a la Llanura del Caribe.

El territorio del Magdalena limita con el Mar Caribe y los departamentos de la Guajira, Cesar, Bolívar y Atlántico, con un perímetro de 1.065 Kms, repartidos de la siguiente forma: